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天然水晶在漫长地质生长中，内部常会留下“生长纹”，就像树木的年轮。你把水晶对着光转动，如果看到平行或弯曲的细密纹路，尤其是沿着晶体表面的天然台阶状纹理（我们行里叫“晶面生长纹”），那就是天然货。人工水晶（也叫合成水晶）生长速度快，内部非常干净、匀净，几乎看不到这种纹路，或者只有很规则、死板的平行线——那是后期机械抛光留下的，不是生长纹。另外，天然水晶内部常有“棉絮”（细小气泡或裂隙）或“冰裂纹”，这些是天然瑕疵，人工品很少这么“不完美”。
天然水晶里的包裹体种类繁多，比如金红石发晶（里面针状矿物）、水胆水晶（包含液态水）、绿幽灵（内含绿泥石）等，这些包裹体形状不规则、分布随机，有立体感。而人工水晶如果硬做包裹体，通常是用颜色染料、碎屑填充，看起来颜色漂浮、边界模糊，或者出现大量圆形、椭圆形的小气泡——尤其是排列整齐的成串气泡，那是人工晶体生长时留下的典型特征。记住：天然水晶很少有那种“一串串”完美的圆气泡，更多是片状、不规则的气液包裹体。
天然水晶是晶体，有双折射性。你拿一根头发放在水晶下面，透过水晶看头发，如果能看到“一分为二”的双影效果（尤其是垂直晶体光轴方向），那基本是天然水晶。人工水晶虽然也是晶体，但往往单晶定向培育，双折射现象不明显甚至没有。当然，这个测试需要水晶有一定厚度（3毫米以上效果更清楚），而且得是纯净透明的晶体。如果水晶是磨成圆珠的不规则面，那这个方法就不太准了。
天然水晶导热性好，上手的第一感觉是凉凉的，而且凉感会持续一会儿，不会马上变成室温。人工水晶（尤其是用玻璃或劣质合成品冒充的）导热性差，上手很快就和手温一样了。当然，这个感觉需要经验，天气太冷或太热时未必准。另外，天然水晶密度一般在2.65g/cm³左右，手掂有压手感，而玻璃仿品密度偏低（约2.4-2.5），手感“飘”，轻飘飘的。但注意，少数人工合成水晶密度和天然差不多，所以手感只能辅助判断。
很多新手觉得水晶越纯净越好，但天然水晶恰恰很难做到绝对无瑕。晶体内部没有一丝棉絮、冰裂、矿坑的天然水晶非常罕见，价格也极贵。市面上那些几十块钱、拇指大还全净透亮的水晶，十有八九是人工合成品或玻璃。正常天然水晶手串或吊坠，总会带一点天然瑕疵，比如细小的雾状棉絮、轻微裂纹、颜色不均等。如果你看到一块水晶（尤其是大件摆件）通体冰透、颜色均匀得像水一样，没有一丝杂质，就要多留个心眼。人工水晶的优点就是能批量生产“完美”货，但缺了自然韵味。
别迷信“用舌头舔水晶看涩不涩”之类的偏方，这既不卫生也不准确。真正实用的方法：如果你经常接触水晶，花几十块买一个便携式偏光镜（几块钱的圆偏光片也可以），把水晶放在偏光镜下转——天然水晶会出现明暗交替的消光现象，而玻璃是均匀暗的。另外，教你个“土办法”：拿水晶在粗糙的陶瓷马赛克上划一道，天然水晶硬度7，能划出白痕（陶瓷釉面），玻璃硬度5.5左右，有时划不痛或留下灰色印子——但这个方法会损坏马赛克，不推荐在别人店里试。
保养上，天然水晶怕强酸碱和高温暴晒。不要用超声波清洗机长时间空洗，容易震出潜在裂纹。日常用软布蘸清水擦净就行，别用洗洁精。如果水晶表面有油污，用稀释的中性洗衣液泡几分钟再冲干净。另外，水晶项链或手串别放在车里被太阳直晒，温差大可能导致内部炸裂。至于“能量”“磁场”之类的说法，纯属个人信仰，不影响收藏价值，但保养好它的品相才是真正的藏家之道。
